L’église Phuong Duc est l'une des églises construites très tôt à Hue. Sous le Seigneur Nguyen Phuc Tan (1648 - 1687), un Portugais en Inde, M. Joao da Crus (un Français a écrit Jean de la Croix) fut venu dans la capitale de Dang Trong (pays de l’Annam) pour aider le Seigneur de Nguyen avec les techniques de moulage du bronze, des armes à feu, le Seigneur fit installer une fonderie sur la rive sud de la rivière des Parfums, en face du chef-lieu Kim Long. La légende raconte qu'avant le premier moulage d'armes à feu, sous prétexte qu'il fallait être béni par le Dieu pour réussir le moulage, Joao da Crus demanda au Seigneur de Nguyen de mettre en place une chapelle pour prier le Dieu, le gouvernement de Nguyen l’accepta.
En 1713, le curé Bennemand de la Société des Missions étrangères de Paris fit également construire une chapelle au pied de la citadelle Loi, loin des berges. Vingt ans plus tard, des curés franciscains ont de nouveau établi une chapelle sur l'ancien site de Joao da Crus, près de la rive et de la fonderie, mais les chapelles étaient toutes en bambou. En 1892, le curé Patiniers fit revaloriser la chapelle en église en bois, construire des murs et des toits avec des tuiles, cette église fut « démontée » par le curé Nguyen Van Tu en 1960 pour reconstruire la nouvelle église, de style européen comme on le voit aujourd'hui.
Les images de l'ancienne église en 1892 montrent que l'église Phuong Duc a une façade en forme de triple portique, presque comme l'église An Vân, devant la cour de l'église, près des deux côtés du sanctuaire principal sont deux bâtiments quadrilatères traditionnels, peut-être le clocher et la maison de stèle. Malheureusement, les anciennes traces ont disparu, cependant, à Noël en 1895, l'ancienne cloche sculptée d’inscription « Minh chuong tu su ca » avec plus de 40 phrases en écriture Nom est un artefact précieux et est bien conservé.
Église Phuong Duc (photo : internet)